En el Norte Grande las tres principales especies en peligro de extinción son:Quirquircho de la puna,picaflor de arica y gato andino.
En el Norte Chico:Chinchilla Cordillerana, puma y vicuña.
En la Zona Centro:Becacina pintada, Carmelita y  Rana Chilena.
En la Zona Sur:Zorro Chilote, Ranita y  Huillín.
En la Zona Austral:Huemul, Ballena jorobada y Delfín Chileno.